Au 14ème siècle, Gaston III Fébus a profité de la Guerre de Cent Ans pour faire du Béarn une principauté souveraine, statut qui subsista jusqu'en 1620. PAU n’a joué pleienement sa fonction de résidence de cour princière que pendant un siècle car, dès 1587, Henri de Navarre est parti à la conquête de Paris pour devenir par la suite Henri IV, Roi de France.
Cependant, à la fin du XVI° début du XVII° siècle, la ville s’est transformée pour accueillir la cour avec notamment la construction d’un Palais de Justice en 1585. En 1716, il est ravagé par un incendie. Il est rebâti pour être abandonné dès 1856 au profit du Palais de Justice actuel.
La Cour de Cassation siègea dans la 1° chambre de la Cour d’Appel de PAU de 1870 à 1871, l'année Terrible, comme l’a appelée Victor Hugo.
Cette salle d’audience est reconnaissable par son imense représentation du Christ sur la croix se situant derrière la chaire. Après la loi de 1905 instituant la séparation de l’Eglise et de l’Etat, cette œuvre a été masquée pendant des décennies par un immense rideau.